Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C16orf70Q9BSU1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C16orf70Q9BSU1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms