Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BPIFA3Q9BQP9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms