Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPAS2Q99743 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPAS2Q99743 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms