Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SIGMAR1Q99720 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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SIGMAR1Q99720 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SIGMAR1Q99720 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SIGMAR1Q99720 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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