Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POP1Q99575 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POP1Q99575 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POP1Q99575 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP1Q99575 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms