Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EYA3Q99504 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EYA3Q99504 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms