Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIN3AQ96ST3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms