Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAM1Q96QH2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms