Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms