Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF396Q96N95 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF396Q96N95 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms