Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF488Q96MN9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms