Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP53Q96M91 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms