Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT74Q96LB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT74Q96LB3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms