Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LINC00208Q96KT6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms