Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPS50Q96JG6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS50Q96JG6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms