Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX27Q96GQ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX27Q96GQ7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms