Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRP36Q96EU6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms