Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRAT1Q92837 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRAT1Q92837 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms