Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX38Q92620 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms