Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clptm1Q8VBZ3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clptm1Q8VBZ3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms