Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
WHAMMQ8TF30 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WHAMMQ8TF30 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms