Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD1Q8NHV4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms