Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP35Q8NFH5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms