Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms