Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC4Q8N9L1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms