Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms