Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM199Q8N511 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM199Q8N511 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms