Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP1Q8N474 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP1Q8N474 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms