Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3G9

TMEM130, Transmembrane protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM130Q8N3G9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM130Q8N3G9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM130Q8N3G9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms