Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LTBP4Q8N2S1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms