Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms