Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT25Q7Z3Z0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT25Q7Z3Z0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT25Q7Z3Z0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT25Q7Z3Z0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT25Q7Z3Z0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT25Q7Z3Z0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms