Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD4Q7Z3J3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD4Q7Z3J3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms