Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSX7Q7RTT5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms