Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms