Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP31Q70CQ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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USP31Q70CQ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP31Q70CQ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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