Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC149Q6ZUS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC149Q6ZUS6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms