Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms