Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HRCT1Q6UXD1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms