Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZBED9Q6R2W3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms