Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMOD2Q6P5Q4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms