Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms