Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAVIN1Q6NZI2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms