Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWSAP1Q6NVH7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWSAP1Q6NVH7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms