Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRNP1Q6NT89 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNP1Q6NT89 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms