Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC70Q6NSX1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms