Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms