Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF123Q5XPI4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms