Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRAGBQ5VZM2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRAGBQ5VZM2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms