Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL1Q5VZK9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms